各地区炎症性肠病患者肠道菌群特征观察性研究

• 作者: 何彦 周宏伟 唐文丽 曾念宜 王忠伟
• 来源期刊: 中华检验医学杂志
• 关键词: 炎性肠疾病 胃肠道微生物组 生态失调 氧化性应激 预测
• 年，卷（期）: 2018,（10）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 734-741
• 页数: 8页
• 字数: 6965字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2018.10.007

摘要

目的 识别不同地区炎症性肠病(IBD)患者肠道菌群生物标志物,建立预测模型,并探索其菌群功能变化特征.方法 收集中国、美国(RISK)、美国(PRISM)、德国、印度和立陶宛6个队列1510例IBD患者和496名健康对照(HC)16 srRNA基因序列.使用微生物组分析软件QIIME(v1.9.1)分析肠道菌群组成和多样性指标,使用微生物多样性分析软件LEfSe比较IBD患者与健康对照有统计学差异的肠菌标志物.随机森林法建立预测模型.PICRUSt预测菌群功能变化特征.结果 IBD患者肠道菌群α多样性显著低于HC(Wilcoxon秩和检验,P<0.05).中国、美国(RISK)、美国(PRISM)、立陶宛和德国队列IBD患者肠道菌群和HC菌差异具有统计学意义(Adonis,P<0.05),而印度队列未发现统计学差异.LEfSe分析显示,中国和美国(RISK)队列IBD患者肠道菌群变化较为一致,而德国、立陶宛和印度IBD患者肠道菌群变化具有较强的本地化特征.肠球菌属(Enterococcus)在中国、美国(RISK)和德国队列IBD患者中显著增加,肠杆菌科(Enterobacteriaceae)在中国和美国(RISK)队列IBD患者肠道显著增加,瘤胃球菌属(Ruminococcus)在中国、美国(RISK)、美国(PRISM)和印度队列IBD患者肠道中显著减少.各国队列分别建模预测当地人群,受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)为(86.48±4.91)％.以其中任一队列模型预测其他队列,中国、美国(RISK)和美国(PRISM)相互间预测AUC较高,其他两者间预测AUC较低.全样本整体建模预测中国、美国(RISK)、美国(PRISM)、德国、立陶宛和印度队列,AUC依次为90.1％、82.3％、79.6％、61.9％、65.5％和54.2％.功能分析显示,中国、美国(RISK)、美国(PRISM)和印度队列IBD患者肠道菌群谷胱甘肽代谢水平明显升高,醌类在中国、美国(RISK)、美国(PRISM)和印度队列IBD患者肠道中合成增加,而细菌的鞭毛组装,运动蛋白等功能在中国、德国和立陶宛队列IBD患者的肠道中明显下降.结论 不同地区IBD患者肠道菌群具有较为一致的特征,但是地理因素依然对菌群产生很大的影响,后续研究需要对该问题进行探索.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周宏伟	南方医科大学珠江医院检验医学部	27	192	7.0	13.0
2	王忠伟	南方医科大学公共卫生学院环境卫生学系	2	5	2.0	2.0
3	何彦	南方医科大学珠江医院检验医学部	3	28	2.0	3.0
4	曾念宜	南方医科大学珠江医院检验医学部	2	10	2.0	2.0
5	唐文丽		1	2	1.0	1.0