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采用分子动力学模拟方法探究Ca2+对VWF-A2结构域稳定性的影响
采用分子动力学模拟方法探究Ca2+对VWF-A2结构域稳定性的影响
作者:
刘文平
吴建华
方颖
谢旭斌
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
血管性血友病因子
A2结构域
钙离子
分子动力学模拟
解折叠
摘要:
目的 探究Ca2+对VWF-A2结构域稳定性的影响.方法 A2和A2/Ca2+的晶体结构取自PDB数据库.通过恒力拉伸分子动力学模拟,比较分析Ca2+结合引起的构象变化、解折叠路径的差异以及酶切位点的暴露程度.结果 A2结构域的解折叠路径和酶切位点的暴露过程是力依赖的.Ca2+结合不影响A2结构域的前期解折叠,但由于α3β4-环链局部构象重排所致柔性降低,约束了β1-β4-β5片层的运动,导致进一步解折叠受阻而停留在中间稳态,影响酶切位点的充分暴露.结论 力可诱导A2结构域中β5片层的解折叠使酶切位点暴露,而Ca2+的结合则通过稳定疏水核心结构,阻碍酶切位点的暴露,最终降低ADAMTS13的酶切效率.研究结果有助于加深对ADAMTS13酶切VWF-A2结构域进而调控VWF止血能力过程的理解,并为相关抗血栓药物设计提供指导.
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篇名
采用分子动力学模拟方法探究Ca2+对VWF-A2结构域稳定性的影响
来源期刊
医用生物力学
学科
医学
关键词
血管性血友病因子
A2结构域
钙离子
分子动力学模拟
解折叠
年,卷(期)
2018,(3)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
248-254
页数
7页
分类号
R318.01
字数
语种
中文
DOI
10.16156/j.1004-7220.2018.03.010
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方颖
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刘文平
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研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
医用生物力学
主办单位:
上海交通大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1004-7220
CN:
31-1624/R
开本:
大16开
出版地:
上海制造局路639号
邮发代号:
4-633
创刊时间:
1986
语种:
chi
出版文献量(篇)
2135
总下载数(次)
2
总被引数(次)
11856
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