扇贝核糖体ITS1和5SrDNA序列的遗传变异及亲缘关系分析

• 作者: 俞小牧 刘阳 周颖 廖德杰 曹善茂 王潇 童金苟
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: ITS1 5SrDNA 岩扇贝(Crassadomagigantea) 遗传变异 亲缘关系
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 页码范围: 494-502
• 页数: 9页
• 分类号: Q959.21
• 字数: 6666字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2018.062

摘要

为探讨引进种岩扇贝(Crassadoma gigantea)及虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)、栉孔扇贝(Chlamys farreri)和海湾扇贝(Argopecten irradians)的遗传变异及其之间的亲缘关系, 研究对4种扇贝的核糖体ITS1序列及5S rDNA序列进行了测定,获得了4种扇贝的ITS1和5S rDNA全序列以及18S rDNA的部分序列,并进行了序列特征、遗传多样性、遗传距离及系统发育等相关分析.结果显示, 基于ITS1序列的单倍型数、核苷酸变异位点、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数及平均核苷酸差异数分别在2—6、1—12、0.425—0.800、0.00081—0.00486和0.366—2.442; 基于5S 序列的相应参数分别在2—5、1—14、0.533—0.841、0.00108—0.01058和0.533—5.726.4种扇贝均表现出较低的多样性水平(π<0.01).此外, 4种扇贝基于2种方法计算的种间遗传距离分别在0.040—0.121和0.042—0.413, 均表现为岩扇贝与虾夷扇贝的遗传距离最近, 而岩扇贝与海湾扇贝遗传距离最远.并且系统进化树分析显示岩扇贝与虾夷扇贝独自聚为一支, 说明引进物种岩扇贝与虾夷扇贝的亲缘关系较近.研究结果将为岩扇贝的种质资源保护以及今后的遗传育种研究工作提供参考信息.