黄秋葵果实转录组测序及分析

• 作者: 姚运法 李和平 洪建基 练冬梅 赖正锋
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 黄秋葵 果实 RNA-Seq技术 SSR标记
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 121-127
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2017-0765

摘要

为了研究黄秋葵果实转录组中功能基因的表达情况,采用RNA-Seq技术对3份黄秋葵果实进行测序分析.结果显示,3份测序材料组装后共获得了77 476个Unigene序列,有61 891个Unigene在4大数据库中得到注释,占79.88％;以KEGG代谢途径数据库为依据,可将13 336个黄秋葵果实的Unigene分成128个代谢途径;在黄秋葵果实转录组中发现3 830个SSR(Simple Sequence Repeats)位点,分布在3 569条Unigenes中,发生频率为4.61％.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖正锋	福建省农业科学院亚热带农业研究所	89	220	7.0	9.0
2	洪建基	福建省农业科学院亚热带农业研究所	96	314	10.0	13.0
3	李和平	福建省农业科学院亚热带农业研究所	55	103	5.0	6.0
4	姚运法	福建省农业科学院亚热带农业研究所	57	123	6.0	8.0
5	练冬梅	福建省农业科学院亚热带农业研究所	37	52	4.0	5.0