肺腺癌长链非编码RNA启动子DNA甲基化的生物信息学分析

• 作者: 张文 李少军 赵英男 郭楠楠
• 来源期刊: 中国肺癌杂志
• 关键词: 肺腺癌 LincRNA DNA甲基化 预后
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 470-475
• 页数: 6页
• 字数: 4041字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3779/j.issn.1009-3419.2018.06.08

摘要

背景与目的 肿瘤相关长链非编码RNA(lincRNA)的异常表达影响癌症的进程,是肿瘤进展机制研究的热点,然而其调控机制目前并不清楚.本研究通过生物信息学方法研究肺腺癌lincRNA启动子DNA甲基化水平与基因表达和预后的关系.方法 从TCGA网站下载肺腺癌Illumina Methylation 450K芯片的全基因组DNA甲基化数据及转录组数据,分析DNA甲基化在lincRNA基因附近的分布情况及与基因表达的关系;比较肿瘤组织和癌旁组织DNA甲基化和表达变化.结果 lincRNA启动子附近DNA甲基化水平较低,且与基因的表达水平呈负相关.在肿瘤组织和癌旁组织间,15个lincRNA的DNA甲基化水平存在显著差异,与其表达呈反向变化,包括与癌症发生发展相关的FINDER基因,该基因启动子高甲基化的肺腺癌病人预后较差,与基因表达作用刚好相反.结论 肺腺癌中一些lincRNA启动子的DNA甲基化水平能调控lincRNA的表达,进而与肺腺癌的预后有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张文	中国人民解放军总医院第一附属医院胸外科	32	91	6.0	7.0
2	郭楠楠	中国人民解放军总医院第一附属医院胸外科	4	14	3.0	3.0
3	李少军	中国人民解放军总医院第一附属医院胸外科	4	51	1.0	4.0
4	赵英男	中国人民解放军总医院第一附属医院胸外科	1	0	0.0	0.0