大豆荚粒数相关QTL的Meta和Overview分析及其候选基因预测

• 作者: 刘春燕 李灿东 李瑞超 李莹莹 王囡囡 程春光 蒋洪蔚 赵圆圆 陈庆山 齐照明
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 荚粒性状 Meta分析 Overview分析 候选基因
• 年，卷（期）: 2018,（11）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 1821-1833
• 页数: 13页
• 分类号: S330
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2018.11.001

摘要

荚粒性状与大豆(Glycine max)产量密切相关.本研究利用完备区间作图法(inclusive composite interval mapping,ICIM)对两年的重组自交系(recombinant inbred line,RIL)群体数据进行分析,获得7个与荚粒性状相关的数量性状基因座(quantitative trait loci,QTL),并搜集了国内外已报道的154个荚粒性状相关QTLs.利用元分析(Meta-analysis)方法得到23个Meta-QTL区间,利用基于统计学原理的Overview方法对这些QTL区间进行优化.经Overview分析,获得13个有效的QTL区间,5个QTL区间被缩小到0.5 Mb.对Meta-QTL区间进行基因注释,获得687个基因,筛选11个基因作为候选基因.11个候选基因参与植物生长发育、果实成熟等过程.本研究建立的实验方法及研究结果,对于大豆荚粒性状QTL定位及分子辅助育种提供了基础资料.