确山黑猪种质资源的亲缘关系研究

• 作者: 乔瑞敏 任广志 叶建伟 吕刚 张晨 李改英 李新建 李明 王克君 王明宇 韩雪蕾
• 来源期刊: 家畜生态学报
• 学科: 农学
• 关键词: 确山黑猪 亲缘关系 D-loop区 多态性
• 年，卷（期）: 2018,（11）
• 所属期刊栏目: 科学研究
• 页码范围: 17-19
• 页数: 3页
• 分类号: S811.5
• 字数: 1885字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-1182.2018.11.004

摘要

基于线粒体DNA的D-loop区段的多态性,通过与主流商业猪种杜洛克猪、长白猪、大白猪,以及邻近地区的淮南黑猪、南阳黑猪、豫西黑猪、二花脸猪、莱芜猪相比较,探讨确山黑猪现存38头公猪个体的亲缘关系.结果表明,与参考序列(NC_000845.1 NCBI)相比,确山公猪存在17个单核苷酸位点变异,转换数(si)与颠换数(sv)的比值(R)为10,碱基替换尚未饱和.确山黑猪共有9种单倍型,聚为7个分支,其中,Hap 1为优势单倍型,存在于21个个体中.同时,提示确山黑猪品种内存在母系血缘分离,但与临近地区猪种相比,则相对集中.河南地方猪种南阳黑猪与Hap1相同.河南地方猪种淮南黑猪及豫西黑猪和Hap4相同.确山黑猪关系整体与中国地方猪较近,与西方商业猪种关系较远.相对于莱芜黑猪,确山黑猪与二花脸关系稍近;相对于杜洛克猪和长白猪,确山黑猪与大白猪关系稍近.