猪圆环病毒2型青海分离株的分子鉴定及进化分析

• 作者: 赵玉清
• 来源期刊: 中国动物检疫
• 学科: 农学
• 关键词: 猪圆环病毒 青海分离株 分子鉴定 Cap基因 序列比对 进化分析
• 年，卷（期）: 2018,（9）
• 所属期刊栏目: 技术支撑
• 页码范围: 81-84,111
• 页数: 5页
• 分类号: S858.28
• 字数: 3171字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-944X.2018.09.021

摘要

本研究对青藏高原地区猪圆环病毒青海分离株(PCV2-QH1)进行了Cap基因的克隆鉴定及测序分析,并与我国及其他国家或地区的毒株进行了同源性比较和遗传进化分析.结果显示:PCV2-Cap基因核苷酸序列全长705 bp,编码蛋白为234个氨基酸,分子量大小约28.06 kDa,为不稳定蛋白,总体亲水性非常高,可溶于水;PCV2-Cap蛋白二级结构以无规则卷曲为主,有多个有效的抗原表位;PCV2-QH1分离株与其他参考序列的核苷酸和氨基酸序列同源性均在99％ 以上;PCV2-QH1分离株与PCV2美国分离株(KU697156)组成一个微小分支,并与美国毒株、韩国毒株聚在一支,表明它们之间的亲缘关系最近.本次对青海分离株PCV2-QH1的鉴定,可为我国猪圆环病毒分子流行病学调查提供数据参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵玉清		5	3	1.0	1.0