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大黄鱼FST基因SNP筛选及与生长性状相关性分析
大黄鱼FST基因SNP筛选及与生长性状相关性分析
作者:
张玉
曹明月
李娟
薛良义
赵亚运
韩明星
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
大黄鱼
卵泡抑素
高分辨率熔解曲线
单核苷酸多态性
生长性状
摘要:
为探索FST基因单核苷酸多态性(SNP)与大黄鱼生长性状的相关性,本研究采用直接测序和高分辨率熔解曲线(HRM)法分别进行SNP位点筛查和验证分型.结果共筛查到19个SNP位点,其中2个在外显子1,8个在外显子2,7个在外显子3,外显子4和外显子5各1个,近端启动子区域未筛查到突变.位于外显子4的g.2169A>C位点,AA基因型占96.8%,CC基因型占3.2%,多态信息含量为0.0600;位于外显子5的g.2998A>G位点,AA基因型占63.2%,AG基因型占30%,GG基因型占6.8%,多态信息含量为0.2828,这2个位点均处于哈代-温伯格平衡状态.相关性分析表明,在g.2169A>C位点,CC型个体各个生长性状(体重、体长、全长、体高)均大于AA型个体,但差异不显著(P>0.05);g.2998A>G位点,AG型个体各性状均值最大,GG型个体最小,但只在全长性状上基因型AG与GG存在显著性差异(P<0.05),表明FST基因编码区的突变对大黄鱼的生长性状有一定的影响.本试验结果为大黄鱼育种中体型的选择提供了一定的理论依据.
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文献信息
篇名
大黄鱼FST基因SNP筛选及与生长性状相关性分析
来源期刊
核农学报
学科
关键词
大黄鱼
卵泡抑素
高分辨率熔解曲线
单核苷酸多态性
生长性状
年,卷(期)
2018,(5)
所属期刊栏目
植物诱变育种·农业生物技术
研究方向
页码范围
883-891
页数
9页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.11869/j.issn.100-8551.2018.05.0883
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李娟
宁波大学海洋学院
17
33
3.0
4.0
2
薛良义
宁波大学海洋学院
82
601
14.0
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3
韩明星
宁波大学海洋学院
2
8
2.0
2.0
4
张玉
宁波大学海洋学院
6
26
3.0
5.0
5
曹明月
宁波大学海洋学院
4
12
3.0
3.0
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赵亚运
宁波大学海洋学院
4
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单核苷酸多态性
生长性状
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
核农学报
主办单位:
中国原子能农学会
中国农业科学院农产品加工研究所(前中国农业科学院原子能利用研究所)
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-8551
CN:
11-2265/S
开本:
16开
出版地:
北京市海淀区圆明园西路2号农产品加工研究所
邮发代号:
创刊时间:
1987
语种:
chi
出版文献量(篇)
4988
总下载数(次)
6
总被引数(次)
55367
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
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核农学报1998
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核农学报2018年第4期
核农学报2018年第3期
核农学报2018年第2期
核农学报2018年第12期
核农学报2018年第11期
核农学报2018年第10期
核农学报2018年第1期
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