新疆塔什库尔干牦牛mtDNA Cytb基因和D-Loop区遗传多样性及系统进化分析

• 作者: 柴志欣 胡丹 钟金城
• 来源期刊: 家畜生态学报
• 学科: 农学
• 关键词: 塔什库尔干牦牛 细胞色素b基因 D-loop区 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2018,（11）
• 所属期刊栏目: 科学研究
• 页码范围: 11-16
• 页数: 6页
• 分类号: S811.5
• 字数: 4844字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-1182.2018.11.003

摘要

为探究塔什库尔干牦牛的遗传多样性和起源进化关系,本研究通过测定和分析塔什库尔干牦牛10个个体细胞色素b基因(Cytb)和D-loop区全序列,分析多态性及构建系统进化树.结果表明:塔什库尔干牦牛Cytb基因全序列长度为1 140 bp,4种核苷酸T、A、G、C的平均比例分别为27.72％、33.21％、12.92％、26.15％;在10个个体中鉴定出3种单倍型,3个变异位点,全部为转换,单倍型的多样性(Hd)为0.378,核苷酸的多样性(Pi)为0.00 205;D-loop区序列全长在890～910 bp之间,4种核苷酸T、A、G、C的平均比例分别为26.12％、34.22％、25.27％、14.39％,共统计出36个SNP位点,其中转换11个,颠换21个,缺失3个,其单倍型多样性(Hd)为0.778,核苷酸多样性(Pi)为0.00 839.在基于Cytb基因的系统进化树中,塔什库尔干牦牛首先与巴州牦牛、青海牦牛聚为一类,之后与西藏牦牛、野牦牛聚为一类;在D-loop区的系统进化分析中,塔什库尔干牦牛则先与麦洼牦牛、大通牦牛聚为一类,之后与西藏牦牛、野牦牛聚为一类,展示出丰富的遗传多样性,同时进一步支持了牦牛和野牦牛划为牛亚科牦牛属的观点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	钟金城		92	727	16.0	22.0
5	柴志欣		22	45	4.0	6.0
9	胡丹		1	4	1.0	1.0