应用BXD小鼠鉴定肾脏发育相关QTLs

• 作者: 张辉 徐福意 李小明 白晓平 袁牡丹
• 来源期刊: 生物技术
• 学科: 生物学
• 关键词: BXD小鼠 肾重比 QTL作图 候选基因
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 585-591
• 页数: 7页
• 分类号: Q311
• 语种: 中文
• DOI: 10.16519/j.cnki.1004-311x.2018.06.0101

摘要

[目的]利用BXD小鼠群体定位肾脏发育相关QTLs及筛选QTLs区段内的候选功能基因.[方法]高脂饲喂BXD小鼠29w龄后,获取各品系小鼠肾脏重量和体重,结合该小鼠群体基因型信息,利用webQTL定位肾重比相关QTLs.为进一步筛选QTLs区段内的功能基因,首先,通过皮尔逊相关性分析,鉴定肾脏mRNA表达水平与肾重比显著相关(P＜0.05)的基因;其次,通过比较C57BL/6J和DBA/2J亲本品系的DNA序列信息,鉴定含有非同义突变的蛋白编码基因;最后,将上述基因导人到Phenolyzer在线分析数据库,并以“kidney”为表型关键词进行检索,优选QTLs区段内的候选功能基因.[结果] BXD小鼠肾重比存在显著差异.经QTL作图,在基因组上共鉴定3个与肾重比相关的QTLs,分别位于四号和X染色体上.在QTLs区段内,共发现45个基因的肾脏mRNA表达水平与肾重比显著相关(P＜0.05),65个基因含有非同义突变,经Phenolyzer在线数据库分析,发现51个基因可能与肾脏发育或肾脏疾病相关.[结论]通过QTL作图,在小鼠基因组上鉴定了3个影响肾脏发育的QTLs,筛选了部分候选基因,后续可做进一步的功能验证来阐明其参与肾脏发育的调控机制.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	白晓平		3	0	0.0	0.0
2	袁牡丹		1	0	0.0	0.0
3	张辉		1	0	0.0	0.0
4	李小明		1	0	0.0	0.0
5	徐福意		1	0	0.0	0.0