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摘要:
不同碱基的DNA分子空间占位和带电状态存在差异,其通过单个纳米孔时可引起特征性的电流脉冲变化,有望成为新一代单分子测序方法.然而,常规条件下DNA分子穿过纳米孔的速度很快(10-2 s),引起的电流变化小(pA级),因此分子亚结构信息的准确获取对现有仪器设备的性能提出了极高要求.本研究在α-溶血素纳米孔的两端分别引入高粘度和离子导电性较好的离子液体支持电解质,以构建粘度梯度体系,并对溶液的酸度进行优化,以期对ssDNA穿孔行为进行调控.初步的研究结果表明,在trans端为纯离子液体BmimPF6,cis端为1 mol/L BmimCl、10 mmol/L Tris-HCl缓冲液(pH 5.5)的条件下,poly(dC)15、poly(dC)20、poly(dC)30和poly(dC)50均出现高抑制比的长阻断电流脉冲信号,长阻断事件的阻断深度达95% 以上,持续时间达10-2~10-1 s;同时,基线噪音峰峰值也降低约30%.对可能的机理进行了探讨.本研究结果表明,采用离子液体粘度梯度支持电解质体系可以有效调控ssDNA的迁移行为.
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基于纳米孔的DNA测序技术
纳米孔测序
传统测序
纳米孔
内容分析
关键词云
关键词热度
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文献信息
篇名 离子液体电解质对DNA穿过α-溶血素纳米孔的影响
来源期刊 分析化学 学科
关键词 单个纳米孔 α-溶血素 单链DNA 离子液体
年,卷(期) 2018,(6) 所属期刊栏目 单分子分析专栏
研究方向 页码范围 858-864
页数 7页 分类号
字数 2806字 语种 中文
DOI 10.11895/j.issn.0253-3820.171404
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 孙珊珊 东北大学理学院分析科学研究中心 1 0 0.0 0.0
2 刘元敏 东北大学理学院分析科学研究中心 2 0 0.0 0.0
3 李光宇 东北大学理学院分析科学研究中心 3 0 0.0 0.0
4 吴志勇 东北大学理学院分析科学研究中心 9 22 3.0 4.0
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研究主题发展历程
节点文献
单个纳米孔
α-溶血素
单链DNA
离子液体
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
分析化学
月刊
0253-3820
22-1125/O6
大16开
长春人民大街5625号
12-6
1972
chi
出版文献量(篇)
9636
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16
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112365
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