尾叶桉苯丙氨酸解氨酶基因的克隆、表达与单核苷酸多态性分析

• 作者: 廖焕琴 张卫华 徐放 杨会肖 杨晓慧 潘文
• 来源期刊: 华南农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 尾叶桉 苯丙氨酸解氨酶 基因克隆 单核苷酸多态性 抗逆性
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 页码范围: 89-94
• 页数: 6页
• 分类号: S718.46|Q943.2
• 字数: 4212字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.2018.02.014

摘要

[目的]通过获得尾叶桉Eucalyptus urophylla苯丙氨酸解氨酶(PAL)基因序列,分析其在不同水肥处理下的表达模式及在尾叶桉群体中的单核苷酸多态性(SNP),为研究该基因与尾叶桉抗逆性的相关性提供基础.[方法]根据巨桉E.grandis的PAL基因序列设计引物,通过基因克隆、测序获得尾叶桉PAL基因序列;采用逆转录定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)分析该基因在不同水肥处理下的表达模式.[结果]PAL基因组全长4507 bp,包括166 bp的5′非编码区、411 bp的3′非编码区、2172 bp的氨基酸编码序列(由2个外显子组成,分别为422和1750 bp)和1759 bp的内含子区域.PAL基因在AT4处理中表达量最高,在AT5处理中表达量最低.尾叶桉PAL基因与巨桉具有高度相似性.尾叶桉PAL基因的SNP位点主要集中在内含子区域,可见尾叶桉PAL基因在长期进化过程中保持着稳定的遗传.[结论]获得尾叶桉PAL基因全长4507 bp,该基因具有遗传稳定性,且可能在尾叶桉抗逆性中起重要作用.