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深圳湾和大鹏湾微生物群落结构及其功能预测比较分析
深圳湾和大鹏湾微生物群落结构及其功能预测比较分析
作者:
路璐
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
微生物多样性
生态环境
Miseq测序技术
基因预测
摘要:
多样性丰富的微生物对海洋生态系统的稳定起着主导作用,采用Illumina Miseq测序技术,针对深圳大鹏湾和深圳湾,综合比较分析两者的表层海水微生物多样性,预测其微生物生态功能差异.结果表明大鹏湾水体微生物群落的Shannon、Simpson、Chao1和ACE多样性指数及菌群OTUs高于深圳湾的水体.大鹏湾和深圳湾的微生物群落在门水平分别有24和10个菌门,两者主导菌门都为蓝藻细菌门、变形菌门、拟杆菌门、放线菌门、厚壁菌门、浮霉菌门,这六个分别占其总微生物群落的99.3%和99.9%.然而各菌门在2个水体中的相对丰度不同,且在纲、目、科、属等分类水平的菌群结果也表明群落组成差异显著,在属水平发现隶属于蓝藻菌门的原绿球藻(60%)主导了深圳湾的表层水体,而大鹏湾的主导蓝藻菌属为未被分离出纯菌株的菌群.代谢功能预测初步揭示了大鹏湾和深圳湾水体微生物的代谢功能有所差异,主要体现在生物降解功能、脂质代谢、酶系统和碳水化合物代谢等方面.该研究为认识海洋微生物多样性与海域生态系统的保护修复提供基础数据和理论支撑.
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文献信息
篇名
深圳湾和大鹏湾微生物群落结构及其功能预测比较分析
来源期刊
西昌学院学报(自然科学版)
学科
地球科学
关键词
微生物多样性
生态环境
Miseq测序技术
基因预测
年,卷(期)
2018,(2)
所属期刊栏目
环境科学
研究方向
页码范围
31-35,封2,封3
页数
7页
分类号
Q938.8|X145
字数
4457字
语种
中文
DOI
10.16104/j.issn.1673-1891.2018.02.008
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
路璐
西华师范大学环境科学与工程学院
14
21
3.0
4.0
传播情况
被引次数趋势
(/次)
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引文网络
引文网络
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Miseq测序技术
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西昌学院学报(自然科学版)
主办单位:
西昌学院
出版周期:
季刊
ISSN:
1673-1891
CN:
51-1689/N
开本:
出版地:
四川省西昌市马坪坝
邮发代号:
创刊时间:
1986
语种:
chi
出版文献量(篇)
2767
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7
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
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学科类型:
数理科学
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