高通量测序法分析两株益生菌对凡纳滨对虾肠道菌群结构的影响

• 作者: 孙金生 尚碧娇 左志晗 李文悦 窦春萌
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 凡纳滨对虾 荚膜红细菌 蜡样芽孢杆菌 高通量测序 肠道菌群
• 年，卷（期）: 2018,（12）
• 页码范围: 1967-1976
• 页数: 10页
• 分类号: S942.5
• 字数: 6170字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20180211184

摘要

为分析荚膜红细菌和蜡样芽孢杆菌2株益生菌对凡纳滨对虾肠道菌群结构的影响,本实验对凡纳滨对虾进行为期30 d的养殖饲喂实验,饲喂后期利用高通量测序凡纳滨对虾肠道微生物的16S rDNA V4区,来分析不同益生菌饲喂后凡纳滨对虾肠道菌群的结构特征,并结合对虾体质量增加率和攻毒后累计死亡率的宏观指标来进行分析.结果显示:①空白组(CK)、荚膜红细菌组(Rc)和蜡样芽孢杆菌组(Bc)样品OTU范围为374～506,其中CK组对虾肠道菌群OTU数量最低,饲喂益生菌后的2组对虾肠道菌群中OTU数量相对较高;②在门分类水平上,3组的变形菌门数均为最多,CK组主要为变形菌门和少量拟杆菌门,Bc组主要有变形菌门、拟杆菌门、无壁细菌门、厚壁细菌门和假单胞菌,Rc组主要是变形菌门、拟杆菌门、厚壁菌门、酸杆菌门、放线细菌、梭杆菌门和蓝细菌;③稀释曲线和Shannon指数结果可见,CK组样品物种丰度和复杂度最低,且Bc组样品丰度和复杂度相对较高;④PCA分析发现,Rc组和CK组样品微生物组成较为接近,结合宏观对虾体质量增加率和攻毒后累计死亡率的结果分析,可见相较于荚膜红细菌,蜡样芽孢杆菌对凡纳滨对虾肠道微生物菌群影响更显著,且益生效果更佳.研究表明,饲喂益生菌可以扩增对虾肠道微生物菌群丰度,并能抑制弧菌属等有害菌群的生长,提高对虾体质量增加率并降低死亡率,从而达到益生效果,其中以饲喂蜡样芽孢杆菌菌株效果更佳.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙金生	天津师范大学生命科学学院天津市动植物抗性重点实验室	49	320	8.0	17.0
2	李文悦	天津师范大学生命科学学院天津市动植物抗性重点实验室	4	11	1.0	3.0
3	左志晗	天津师范大学生命科学学院天津市动植物抗性重点实验室	9	25	3.0	5.0
4	尚碧娇	天津师范大学生命科学学院天津市动植物抗性重点实验室	4	10	1.0	3.0
5	窦春萌	天津师范大学生命科学学院天津市动植物抗性重点实验室	2	18	2.0	2.0