大鼠C6胶质瘤细胞的基因表达谱

• 作者: 唐传喜 孙蕾 张琳 沙岩 王丹 高殿帅
• 来源期刊: 神经解剖学杂志
• 关键词: 胶质瘤 转录组测序 差异表达基因 GO KEGG 大鼠
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 原著
• 页码范围: 1-8
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.16557/j.cnki.1000-7547.2018.01.001

摘要

目的:筛选比较大鼠C6胶质瘤细胞与正常星型胶质细胞中的差异表达基因.方法:利用IlluminaHiSeq4000技术对大鼠C6胶质瘤细胞和正常星形胶质细胞进行转录组测序并对测序结果进行功能注释.以| log2 FoldChange |≥1和q值＜0.05为标准筛选差异表达基因,并通过GO和KEGG数据库分析其功能和参与的信号通路.结果:较之正常星形胶质细胞,大鼠C6胶质瘤细胞中共筛选得到4363个差异表达基因,其中1603个基因表达上调,2760个基因表达下调;GO富集结果表明:4109个差异表达基因共映射到906个GOterm,主要与GTP酶活性正性调节、基因表达正性调节、蛋白结合和钙离子结合等功能相关;KEGG富集结果表明:1535个差异表达基因共参与106条通路,富集最多的是PI3K-Akt信号通路和癌症发生通路.结论:成功获取大鼠C6胶质瘤细胞与正常胶质细胞的基因表达谱,并对其差异基因进行GO和KEGG注释,结果有助于胶质瘤发生发展的研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王丹	徐州医科大学医学信息学院	31	22	3.0	3.0
2	沙岩	徐州医科大学医学信息学院	17	6	1.0	1.0
3	张琳	徐州医科大学护理学院	7	1	1.0	1.0
7	高殿帅	徐州医科大学神经生物学实验中心	24	25	3.0	4.0
8	唐传喜	徐州医科大学神经生物学实验中心	2	1	1.0	1.0
9	孙蕾		2	3	1.0	1.0