缢蛏生长因子受体结合蛋白2基因克隆、时空表达及SNP筛查

• 作者: 姚韩韩 崔宝月 林志华 董迎辉 赵家熙
• 来源期刊: 海洋学报（中文版）
• 学科: 地球科学
• 关键词: 缢蛏 生长因子受体结合蛋白2 克隆 SNP
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 87-94
• 页数: 8页
• 分类号: P917.4
• 字数: 4196字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0253-4193.2018.02.009

摘要

为了探索生长因子受体结合蛋白2 (GRB2)在缢蛏生长发育中的作用,本实验基于缢蛏转录组文库,利用SMART RACE技术克隆缢蛏GRB2(Sc-GRB2)基因的cDNA全长序列,分析其在不同组织和发育时期的表达差异,并在外显子中进行了SNP位点筛选.结果表明,Sc-GRB2基因cDNA全长1 223 bp,开放阅读框711 bp,编码236个氨基酸;氨基酸序列比对发现,缢蛏与文蛤、泥蚶等双壳贝类同源性较高(64％00、59％),而与其他物种的同源性为45％～58％,表明GRB2基因比较保守;不同组织的荧光定量PCR (qRT-PCR)结果显示,Sc-GRB2基因在缢蛏7个组织中均有表达,其中足中的表达量极显著地高于其他6个组织(P＜0.01);在8个发育时期的表达差异分析发现,该基因在稚贝期表达量极显著地高于其他7个时期(P＜0.01).SNP位点筛选结果表明,在Sc-GRB2基因的外显子区域共发现11个SNP位点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林志华	浙江万里学院浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室	66	512	13.0	17.0
2	董迎辉	浙江万里学院浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室	39	373	12.0	16.0
3	姚韩韩	浙江万里学院浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室	22	170	9.0	12.0
4	赵家熙	浙江万里学院浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室	1	3	1.0	1.0
5	崔宝月	上海海洋大学水产与生命学院	1	3	1.0	1.0