miR-181a-5p靶基因预测及其在鹅卵泡颗粒层中的表达分析

• 作者: 王继文 莫远亮 邓艳
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: miR-181a-5p GO和KEGG分析 表达分析 颗粒细胞 增殖 凋亡
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 页码范围: 95-102
• 页数: 8页
• 分类号: S835
• 字数: 4675字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2018.06.013

摘要

为深入探究miR-181a-5p在鹅颗粒细胞中可能的功能及其作用机制奠定基础.以多个网络数据库资源为基础,通过生物信息学的方法预测可能的靶基因及其信号通路,然后利用qPCR检测miR-181a-5p及其靶基因在不同阶段颗粒层中的表达水平.结果显示,miR-181a-5p在脊椎动物中高度保守;靶基因的GO和KEGG分析发现,miR-181a-5p主要参与调控细胞的增殖、分化、凋亡等过程,多数靶基因主要富集到FOXO、MAPK、PI3K-Akt等信号通路;根据靶基因互作网络图,筛选出10个核心靶基因VEGFA、MAPK1、FOS、KRAS、HRAS、SIRT1、BCL2、ESR1、PTEN和CD-KN1A,其中多数靶基因均与细胞增殖凋亡相关.结果表明,miR-181a-5p在2～4 mm表达量最高,但在4～6 mm急剧下降,之后在4～6 mm、8～10 mm、F5这3个阶段均呈现显著上升趋势.miR-181a-5p可能通过靶向调控SIRT1、BCL2、CDKN1B、PTEN等基因,参与FOXO、MAPK、PI3K-Akt等信号通路来调控颗粒细胞的增殖凋亡过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王继文	四川农业大学动物科技学院畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室	125	673	13.0	21.0
2	莫远亮	四川农业大学动物科技学院畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室	2	23	1.0	2.0
3	邓艳	四川农业大学动物科技学院畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室	1	1	1.0	1.0