早发型子痫前期相关microRNA和靶基因的挖掘及生物信息学分析

• 作者: 朱雪琼 李亚先 欧阳栋
• 来源期刊: 农垦医学
• 学科: 医学
• 关键词: 早发型子痫前期 microRNA 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 基础与临床医学
• 页码范围: 494-499
• 页数: 6页
• 分类号: R714.245
• 字数: 4225字
• 语种: 中文

摘要

目的:研究早发型子痫前期(EOPET)胎盘组织中miRNA的表达差异,并应用生物信息学方法分析筛选关键的miRNA和靶基因,探索早发型子痫前期发病的分子机制.方法:从公共基因芯片数据库(GEO)搜索有关早发型子痫前期miRNA、mRNA表达的数据(GSE 103542、GSE74341),利用R软件分别筛选早发型与晚发型子痫前期、正常对照的胎盘组织中表达差异的miRNA和mRNA,采用miRWalk软件对7种差异性表达miRNA的相关靶基因进行预测,并与筛选出的差异mRNA取交集即为得到的靶基因,将靶基因通过cytoscape,DAVID软件进行网络分析寻找核心分子.结果:共筛选出6个早发型子痫前期相关的miRNAs和86个相关的靶基因,这些靶基因主要与cGMP-PKG信号通路、类风湿性关节炎通路、局部粘附、HIF-1信号通路有关,蛋白质网络互作预测得到了4个重要的EOPET相关蛋白质靶标,分别为COL5A1、COL6A1、DCN、ENG等基因.结论:通过对GEO数据集进行数据挖掘,共挖掘出6个早发型子痫前期相关的miRNAs,在其作用的靶基因中挖掘出4个关键的靶基因,今后对其进一步研究,将有助于阐释EOPET的分子机制,开发新型生物标志物和治疗靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李亚先		11	13	2.0	3.0
2	朱雪琼		4	7	2.0	2.0
3	欧阳栋		5	15	1.0	3.0