葡萄幼叶环状RNA(CircRNA)的鉴定与分析

• 作者: 吴新颖 张倩倩 张加魁 慕茜 李益 杨立英 王咏梅 王鹏飞 蒋锡龙 陈迎春
• 来源期刊: 中外葡萄与葡萄酒
• 学科: 农学
• 关键词: 葡萄 幼叶 环状RNA miRNA 靶基因
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 32-38
• 页数: 7页
• 分类号: S663.1|Q75
• 字数: 5141字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13414/j.cnki.zwpp.2018.06.006

摘要

本研究以‘赤霞珠’葡萄幼叶为试材,构建环状RNA测序文库并鉴定了1172个环状RNA.结果表明,这些环状RNA的来源基因涉及多种功能,包括抗逆、抗病、发育等,并且这些环状RNA中有74个可以结合73种葡萄miRNA,而大部分不能结合miRNA.这73种可以结合环状RNA的葡萄miRNA共靶向710个靶基因.很多涉及的miRNA都对应了个10以上靶基因.比较了靶基因和环状RNA来源基因,发现有很多功能类似,但是也有很多不同的功能.GO分析显示二者最富集的条目都是细胞、细胞部分、细胞器、催化活性及绑定.但是二者被注释的条目种类差别很大.说明葡萄环状RNA来源于不同种类的基因,且可能调控多种基因.