虾夷扇贝EST-SSR标记在栉孔扇贝中的通用性研究

• 作者: 刘寒苗 刘志鸿 吴彪 周丽青 孙秀俊 张广明 杨爱国 赵庆
• 来源期刊: 渔业科学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 虾夷扇贝 栉孔扇贝 EST-SSRs 微卫星 多态性 通用性
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 139-146
• 页数: 8页
• 分类号: S968.31
• 字数: 3558字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19663/j.issn2095-9869.20170503002

摘要

为研究虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)和栉孔扇贝(Chlamys farreri)的群体遗传多样性并分析其亲缘关系,对在虾夷扇贝中开发的60个EST-SSR位点在栉孔扇贝中的通用性进行了研究.结果显示,21个位点可在栉孔扇贝中扩增出特异性条带,通用性比例达35.00％,其中,17个位点具有多态性,多态性比例达28.33％.在虾夷扇贝和栉孔扇贝群体中,平均等位基因数(Na)分别为2.7647和2.3529;平均有效等位基因数(Ne)分别为1.9487和1.6350;平均观测杂合度(Ho)为0.6314和0.3333;平均期望杂合度(He)为0.4569和0.3139;平均多态信息含量(PIC)为0.3726和0.2597;Nei's (1973)基因多样性指数(I)分别为0.4493和0.3087;Shannon信息指数分别为0.7176和0.5041;固定指数(Fis)检测发现,7个位点偏离了Hardy-Weinberg平衡;遗传分化系数(Fst)为0.2398.本研究开发的21对通用性EST-SSR标记,为进一步开展虾夷扇贝和栉孔扇贝遗传多样性分析、分子辅助育种、基因发掘和种质资源评价奠定了基础.