斑头雁成鸟与雏鸟泄殖腔微生物的对比分析

• 作者: 孙浩 李来兴 杨芳 王爱真 王稳 王雪莲 郑思思
• 来源期刊: 动物学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 斑头雁 泄殖腔微生物 微生物组 高通量测序 年龄
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 641-651
• 页数: 11页
• 分类号: Q939
• 语种: 中文
• DOI: 10.13859/j.cjz.201804015

摘要

肠道微生物通过维持稳态、辅助消化和促进免疫系统发育等方式维护宿主的健康状态.肠道微生物本身则受到宿主的基因、饮食、年龄和环境等因素的影响.然而,肠道微生物的变化与宿主年龄之间的关系仍有许多未知.本研究分别收集斑头雁(Anser indicus)2只成鸟及3只雏鸟泄殖腔样品,提取肠道微生物总DNA,采用16S rRNA高通量测序的方法,分析并比较两年龄阶段鸟类肠道微生物的菌群结构及组成差异.研究发现,斑头雁雏鸟泄殖腔微生物属于9个门,含量最高的前5个门分别是梭杆菌门(48.29％)、厚壁菌门(22.21％)、变形杆菌门(22.07％)、放线菌门(5.02％)和软壁菌门(1.93％).成鸟泄殖腔微生物属于17个门,最多的依次是变形菌门(64.69％)、厚壁菌门(23.92％)、蓝细菌(8.48％)、放线菌门(1.43％)和梭杆菌门(0.56％).在属的水平,斑头雁雏鸟泄殖腔微生物属于18个属,而成鸟含有24个属.成鸟泄殖腔微生物的α多样性显著高于雏鸟(P＜ 0.05,Welch's t-test).有1 86个操作分类单元(OTU)属于成鸟和雏鸟共有,而其他640个OTU和90个OTU则分别隶属于成鸟和雏鸟.雏鸟中67.39％的OTUs是成鸟所具有的.基于OTU的聚类结果与年龄分组一致.本结果对认识鸟类肠道微生物与宿主年龄变化之间的关系有一定的参考价值.