DBAT酶的同源建模及与多样性底物对接

• 作者: 叶志伟 林俊芳 林淑玲 欧阳萍兰 郑倩望 郭丽琼 魏韬 黄佳俊
• 来源期刊: 化学研究与应用
• 学科: 化学
• 关键词: 紫杉醇 巴卡亭Ⅲ DBAT 同源建模 分子对接 活性口袋
• 年，卷（期）: 2018,（8）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1246-1251
• 页数: 6页
• 分类号: O643.1
• 字数: 3502字
• 语种: 中文

摘要

10-去乙酰巴卡亭Ⅲ乙酰基转移酶(DBAT)是紫杉醇生物合成途径中催化10-去乙酰巴卡亭Ⅲ生成巴卡亭Ⅲ的一个关键酶,由于其催化效率低,使得天然巴卡亭Ⅲ和紫杉醇含量都很低,紫杉醇细胞工厂的构建也受到严重制约.本研究利用MODELLER同源建模软件,构建了未报道晶体结构的DBAT三维结构模型,结合分子动力学模拟DBAT在稳定状态前后氨基酸的位置变化,分析关键氨基酸改变对酶催化活性的影响,获得位点His162和Arg365.利用虚拟定点突变和分子对接技术,推断His162为关键活性氨基酸残基,Arg365的空间位阻效应可影响催化反应过程.本研究为后续DBAT催化机理的解析提供潜在靶点,并为DBAT分子设计奠定基础.