一个凤丹PoFAD2基因家族新成员PoFAD2-2的克隆及表达模式分析

• 作者: 孙静 孟家松 张克亮 陈明 陶俊
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 凤丹 脂肪酸脱氢酶2 生物信息学 荧光定量
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 1339-1346
• 页数: 8页
• 分类号: S565.9|S685.11
• 字数: 4796字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2018.06.020

摘要

脂肪酸脱氢酶2(FAD2)能将油酸催化成亚油酸,是单不饱和脂肪酸转化为多不饱和脂肪酸的关键酶.本研究根据筛选到的PoFAD2-2基因序列,克隆到凤丹PoFAD2-2基因全长的cDNA,命名为PoFAD2-2.其开放阅读框为1155 bp,编码384个氨基酸,蛋白质分子量为44000,等电点为8.51.生物信息学分析结果显示,该基因编码的蛋白质偏亲水性,包含5个跨膜结构域,属于膜结合型的FAD超家族.多序列比对与系统进化树分析结果发现,PoFAD2-2基因与PoFAD2-1基因亲缘关系较远,对于PoFAD2-2基因,凤丹在进化上与油橄榄[Olea europaea(common olive)(KY652929.1)]、靛木[Wrightia tinctoria(GU190864.1)]的相似性较高.荧光定量分析结果表明,PoFAD2-2在根和子房中没有表达,在花中的相对表达量最高,随着种子逐渐成熟,PoFAD2-2在种子中的表达量先逐渐降低再升高然后再降低,表明此基因表达具有组织特异性.PoFAD2-2基因在种子发育进程中的表达趋势与PoFAD2-1相同.