杭州湾入海口沉积物原核生物多样性分析

• 作者: 周阳靖 唐方园 张秋芳 徐继荣 李双彤 程军蕊 郑琦宏
• 来源期刊: 生物学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 沉积物 原核生物多样性 16S rRNA基因 高通量测序 杭州湾入海口
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 47-51
• 页数: 5页
• 分类号: Q938
• 字数: 3107字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1736.2018.03.047

摘要

为了解杭州湾入海口沉积物中原核生物多样性特征及其与环境因子的关系,应用Illumina Miseq测序平台对原核微生物16S rRNA基因V3-V4区序列进行了高通量测序,分析了杭州湾入海口13个点位的沉积物原核生物多样性特征.结果表明:1)共有原核生物65个门、210个纲、419个目、688个科和1118个属,Shannon-Wiener指数平均值达9.72;主要优势菌有变形菌(Proteobacteria)、绿弯菌(Choloroflexi)和拟杆菌(Bacteroidetes)等,其中变形菌相对丰度最大;2)杭州湾南岸沉积物中厚壁菌(Firmicutes)的丰度比北岸高,对比上虞工业区和金山工业区排污口的样品可以发现,前者β变形菌相对丰度较高,而后者γ变形菌的相对丰度较高;3)绿菌(Chlorobi)、放线菌(Acti-nobacteria)、拟杆菌和β变形菌(β-Proteobacteria)等相对丰度与总有机碳(TOC)显著相关;拟杆菌、放线菌和酸杆菌(Acidobacteria)等相对丰度与pH值显著相关;Fe和As皆与α变形菌、GN04和绿菌丰度具有显著相关性,Mn和Cu也分别与GN04和螺旋体(Spirochaetes)显著相关.因此,应用高通量测序方法可用于杭州湾入海口原核生物群落多样性特征分析,进而了解该区域原核生物分布与环境之间的相关关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑琦宏	宁波大学建筑工程与环境学院	20	259	7.0	16.0
2	程军蕊	宁波大学建筑工程与环境学院	19	150	7.0	12.0
3	徐继荣	宁波大学建筑工程与环境学院	24	275	8.0	16.0
4	李双彤	宁波大学建筑工程与环境学院	1	0	0.0	0.0
5	张秋芳	泉州师范学院海洋与食品学院	1	0	0.0	0.0
9	周阳靖	宁波大学建筑工程与环境学院	5	9	2.0	2.0
10	唐方园	宁波大学建筑工程与环境学院	2	3	1.0	1.0