肾癌转移关键基因的Top250基因集富集分析

• 作者: 张海宝 徐珊 杜岳峰 田娟华 种岳 穆丽君 贺大林
• 来源期刊: 现代泌尿外科杂志
• 关键词: 肾癌 基因表达综合数据库(GEO) 肿瘤转移 基因主体(GO) 关键基因
• 年，卷（期）: 2018,（8）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 620-625
• 页数: 6页
• 分类号: R737.11
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-8291.2018.08.013

摘要

目的 筛选影响肾癌转移的关键基因,为肾癌治疗研究奠定科学依据.方法 从基因表达综合数据库(GEO)下载基因表达谱(GSE47352),利用GEO2R在线分析提取肾癌转移患者和未转移患者显著表达差异的前250位基因,运用基因本体(GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析、PPI(蛋白质-蛋白质互作用)网络构建以及Venn分析方法,筛选影响肾癌转移的核心基因.结果 通过对比富集分析,PPI以及Venn分析结果,我们发现肾癌转移患者和未转移患者显著变化是细胞应激、细胞粘附特性、血管生成以及细胞向外信息传递等生物学功能,其中粘连蛋白α4链(LAMA4)和JUN有可能是肾癌转移的核心基因.结论 JUN和LAMA4可能在肾癌转移中发挥着重要作用,是肾癌转移的核心基因,本研究后续将对JUN和LAMA4基因进行生物学功能验证.