云南省271株结核分枝杆菌分离株基因分型研究

• 作者: 杨慧娟 杨星 杨蕊 茹浩浩 许琳 闫双群 陈连勇 陈金瓯 马利
• 来源期刊: 中华预防医学杂志
• 关键词: 结核 分枝杆菌,结核 基因型
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 62-67
• 页数: 6页
• 字数: 4501字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0253-9624.2018.01.012

摘要

目的 分析云南省6州(市)结核分枝杆菌分离株的基因分型情况.方法 实验菌株来源于2014年1—12月在云南省6个州(市)疾病预防控制中心保存的结核分枝杆菌临床分离菌株,共271株.采用Spoligotyping和12个VNTR位点的多位点数目可变串联重复序列分析方法(MLVA),对上述结核病分枝杆菌分离株进行基因分型,Spoligotyping分型结果与SITVITWEB数据库进行比较确定菌株的基因家族,MLVA结果采用BioNumberics 5.0软件进行聚类分析.结果271例结核病患者年龄为(41.9±15.1)岁,男性为196例(72.32%);其中普洱市来源的菌株数最多,共94株(34.69%).Spoligotyping分型:271株菌可分为40个基因型,包括16个基因簇和24个独立基因型;其中北京基因型菌株为151株(55.72%),非北京基因型为120株(44.28%).MLVA分型:分位2个基因群,包括207个基因型(30个基因簇,177个独立基因型),成簇率为23.62%;其中Ⅰ群为120株,成簇率为16.67%;Ⅱ群为151株,成簇率为29.14%.12个VNTR位点在全部MTB中的总分辨力为0.993,北京基因型和非北京基因型菌株中的总分辨力分别为0.982和0.995.结论 云南省结核分枝杆菌主要流行株仍以北京基因型为主,结核分枝杆菌基因型存在明显多态性分布,部分地区可能存在北京基因型的近期传播,应开展早期快速诊断和治疗,切断传播链,防止结核病疫情暴发.