利用转录组数据开发意大利蜜蜂的SSR分子标记

• 作者: 付中民 庄天艺 熊翠玲 郑燕珍 郭睿 陈华枝 陈大福 陈恒
• 来源期刊: 安徽农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 转录组 意大利蜜蜂 SSR 特异性引物
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 动物科学与动物医学
• 页码范围: 404-408
• 页数: 5页
• 分类号: S893.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.13610/j.cnki.1672-352x.20180620.015

摘要

意大利蜜蜂(简称意蜂)是自然界重要的授粉昆虫,广泛用于世界各国的养蜂生产,具有很高的生态和经济价值.为了开发意蜂的SSR分子标记,利用MISA软件对基于前期获得的意蜂幼虫肠道转录组数据组装得到的12 115条unigenes进行搜索,共预测出分布于2 149条unigenes的6 312个SSR住点,其中主要的重复类型为二核苷酸重复(54.42％)和三核苷酸重复(32.49％),主要基元为AT/AT (31.2％)和AG/CT (18.6％).进一步利用软件设计出18444对特异性引物,随机选取24对引物对国内3个不同来源的意蜂幼虫样品进行SSR位点扩增,有22对成功扩增出目的片段.研究开发出的SSR分子标记可用于意蜂的种群遗传和分子进化等研究,结果表明利用转录组数据鉴定非模式生物SSR位点的方法可行且高效.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	付中民	福建农林大学蜂学学院	33	121	6.0	9.0
2	陈大福	福建农林大学蜂学学院	47	227	8.0	12.0
3	熊翠玲	福建农林大学蜂学学院	17	53	4.0	6.0
4	郭睿	福建农林大学蜂学学院	19	42	4.0	4.0
5	郑燕珍	福建农林大学蜂学学院	14	45	4.0	6.0
6	陈华枝	福建农林大学蜂学学院	2	8	2.0	2.0
7	陈恒	福建农林大学蜂学学院	2	3	1.0	1.0
8	庄天艺	福建农林大学蜂学学院	1	2	1.0	1.0