文蛤SRBI基因克隆及其在不同壳色群体中的差异表达

• 作者: 姚韩韩 崔宝月 李晓英 林志华 胡凌威 董迎辉 赵家熙
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 文蛤 SRBI 基因克隆 内含子 壳色
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 页码范围: 488-493
• 页数: 6页
• 分类号: S968.3|Q785
• 字数: 3814字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2018.061

摘要

为了研究SRBI基因的结构、功能以及在贝类壳色形成中的作用,利用SMART RACE技术克隆得到文蛤(Meretrix meretrix) SRBI (Mm-SRBI)基因的全长序列, 并对其内含子特征及不同组织、不同壳色群体外套膜中的表达差异进行了分析.结果表明:Mm-SRBI基因cDNA全长1676 bp,开放阅读框1515 bp,编码504个氨基酸,结构域预测发现有一个CD36结构域; 氨基酸序列比对发现, 与华贵栉孔扇贝的同源性最高(55%), 与其他物种的相似性在34%—40%,表明该基因变异较大;在Mm-SRBI基因中扩增出12个内含子,均存在于开放阅读框中,且都遵循GT-AG原则;荧光定量PCR(qRT-PCR)结果表明,Mm-SRBI在闭壳肌、外套膜、斧足、鳃、内脏团和水管6个组织均有表达, 其中在外套膜中表达量显著高于其他组织(P<0.01), 这可能与外套膜中类胡萝卜素含量较高有关; 不同壳色群体外套膜中基因表达分析表明, Mm-SRBI在黑斑和红壳文蛤中的表达量显著高于白壳文蛤(P<0.05).实验结果为文蛤壳色形成研究奠定了基础.