12个新城疫病毒分离株的F基因和HN基因序列分析

• 作者: 刘敏芳 张济培 张溢珊 曹梦蕊 李荣旭 谭华龙 陈建红 陈济铛
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 新城疫病毒 F基因 HN基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2018,（9）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 30-35
• 页数: 6页
• 分类号: S852.659.5|Q789
• 字数: 3232字
• 语种: 中文

摘要

自1997年-2016年从广东佛山、肇庆、云浮等地疑似新城疫的家禽病料分离鉴定获得12株新城疫病毒,采用RT-PCR方法对所有分离株的F基因和HN基因进行扩增,产物经克隆并测序后与Gen-Bank数据库中的参考毒株做遗传进化分析.12个分离株的F基因遗传进化分析结果显示,9株属于基因Ⅶ型,2株属于基因Ⅸ型,1株属于基因Ⅵ型.F基因同源性分析结果显示,12个毒株与目前疫苗株La Sota、B1、Mukteswar和Clone30的同源性在81.6％～91.5％之间,12个毒株间同源性的差异较大,9个Ⅶ型分离株之间的同源性在84.8％～99％之间;HN基因同源性分析结果显示,12个毒株与目前疫苗株La Sota、B1、Mukteswar和Clone30的同源性在80.9％～91.9％之间,12个毒株间同源性的差异较大,9个Ⅶ型分离株之间的同源性在84％～98.5％之间.氨基酸序列分析表明,12个分离株与NDV强毒株的氨基酸特征相符,有10个分离株的HN基因第514氨基酸残基出现Ⅰ→Ⅴ的变异,有9个分离株的F基因和HN基因的中和抗原位点出现变异.试验提示,当前广东部分地区的分离株与传统疫苗株之间存在抗原性差异,故应加强广东地区新城疫病毒的分子遗传监控.