牛ODF2和PDF2转录组测序筛选卵泡发育的相关基因

• 作者: 吕丽华 朱芷葳 李鹏飞 毕锡麟 王锴 郝庆玲
• 来源期刊: 《福建农林大学学报（自然科学版）》
• 关键词: 牛 偏差期后的第二大卵泡(ODF2) 偏差期前的第二大卵泡(PDF2) 转录组 发育 功能
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 439-445
• 页数: 7页
• 分类号: S823.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.13323/j.cnki.j.fafu(nat.sci.).2018.04.010

摘要

为研究牛卵泡发育过程中影响卵泡发育的重要调控基因及其表达模式,通过B超声波监测并采集牛卵泡发育波中出现偏差期后的第二大卵泡(ODF2)和偏差期前的第二大卵泡(PDF2),建立卵泡颗粒细胞RNA文库并进行高通量测序;测序结果经数据库搜索和差异表达筛选,采用DAVID软件GO和KEGG通路分析,再经GeneCards功能查询筛选牛卵泡发育的相关基因.结果表明:转录组测序共获得35325个基因,其中,高表达基因15536个,进一步筛选出504个差异表达基因;GO分析表明,504个差异表达基因中参与生物过程的基因占39.49％,细胞组分占46.96％,分子功能占13.55％;KEGG通路分析表明,共有97个差异表达基因通过10条信号通路参与牛卵泡发育调控(P<0.05),经GeneCards进行功能查询后,共筛选出18个与牛卵泡发育密切相关的调控基因.在卵泡发育过程中,PYCARD、MYC、PRICKLE1、TGFBR3、PIK3R3、SOX4、TOPORS、KREMEN1、STK11和NTRK1可能直接参与细胞增殖或凋亡.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吕丽华	山西农业大学动物科技学院	67	172	7.0	8.0
2	朱芷葳	山西农业大学生命科学学院	54	223	7.0	13.0
3	李鹏飞	山西农业大学生命科学学院	65	175	7.0	9.0
4	郝庆玲	山西农业大学生命科学学院	10	11	2.0	2.0
5	王锴	山西农业大学动物科技学院	11	17	3.0	3.0
6	毕锡麟	山西农业大学动物科技学院	10	17	3.0	3.0