用传统分离培养法和高通量测序技术分析印度块菌子囊果内细菌的群落结构

• 作者: 刘培贵 刘建利 邓晓娟 闫兴富
• 来源期刊: 生物多样性
• 关键词: 印度块菌 子囊果 细菌 培养 高通量测序
• 年，卷（期）: 2018,（12）
• 所属期刊栏目: 微生物多样性
• 页码范围: 1318-1324
• 页数: 7页
• 字数: 4644字
• 语种: 中文
• DOI: 10.17520/biods.2018184

摘要

块菌是重要的经济真菌,在其生长发育过程中,细菌扮演了重要角色.本文利用传统分离培养方法和高通量测序技术分析了印度块菌(Tuber indicum)子囊果内细菌的群落结构.共分离得到细菌532株,根据物种累积曲线,选取其中的112株细菌进行了16S rRNA基因序列分析,共鉴定出4属40种,其中假单胞菌属(Pseudomonas)菌株占所测菌株数的80％,不动杆菌属(Acinetobacter)占12.5％,链霉菌属(Streptomyces)占5％,贪噬菌属(Variovorax)占2.5％.通过对印度块菌子囊果16S rRNA基因的V1-V3区高通量测序分析,共获得细菌序列9,862条,分属于7门43属220种,其中变形菌门、拟杆菌门和放线菌门的物种占总物种数的99.7％,是印度块菌子囊果内的优势细菌.黄杆菌属(Flavobacterium)、壤霉菌属(Agromyces)、微杆菌属(Microbacterium)、剑菌属(Ensifer)和寡养食单胞菌属(Stenotrophomonas)的物种数占总物种的86.3％,是印度块菌子囊果内细菌的优势属.研究结果表明,采用胰蛋白大豆培养基仅分离得到印度块菌子囊果内少数细菌物种,而采用高通量测序技术分析发现,印度块菌子囊果内细菌物种种类丰富,群落结构复杂.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘培贵	中国科学院昆明植物研究所生物多样性与生物地理学重点实验室	36	538	12.0	23.0
2	闫兴富	北方民族大学生物科学与工程学院	69	513	13.0	17.0
3	刘建利	北方民族大学生物科学与工程学院	55	292	10.0	14.0
4	邓晓娟	北方民族大学生物科学与工程学院	5	2	1.0	1.0