结合吸烟与遗传因素交互作用鉴定骨质疏松症易感基因

• 作者: 杨波 段媛媛 郭燕 陈晓峰
• 来源期刊: 西安交通大学学报（医学版）
• 关键词: 骨质疏松 吸烟 基因表达谱 双因素方差分析 基因环境互作 间隙连接
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 技术方法研究
• 页码范围: 589-596
• 页数: 8页
• 分类号: R580
• 语种: 中文
• DOI: 10.7652/jdyxb201804028

摘要

目的 系统分析吸烟与骨质疏松症间的交互作用,挖掘互作基因,阐明吸烟影响骨质疏松症的功能机制.方法 整合基因表达谱数据,通过双因素方差分析挖掘吸烟和骨质疏松症遗传因素互作基因,并结合通路富集分析挖掘功能性骨相关代谢通路.利用 GWAS芯片,通过基因环境互作分析验证功能通路内互作基因,最后利用蛋白网络分析发掘互作基因参与的核心调控网络.结果 表达谱分析鉴定了441 个同时与吸烟和骨质疏松症密切相关的风险基因;通路富集分析揭示了吸烟调控骨质疏松症的潜在关键代谢通路—间隙连接;通过全基因组基因环境互作分析,我们验证了多个潜在关键风险基因,并且通过蛋白网络分析揭示了 1 个包含 13 个蛋白的潜在吸烟骨质疏松症互作核心调控网络.结论 本研究发现了 1 个潜在的吸烟影响骨质疏松症的分子调控模型,对于相关疾病机制认识及后续药物靶点开发提供了新思路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭燕	西安交通大学生命科学与技术学院生物医学信息工程教育部重点实验室	18	99	5.0	9.0
2	杨波	陕西省人民医院骨科	7	27	3.0	5.0
3	陈晓峰	西安交通大学生命科学与技术学院生物医学信息工程教育部重点实验室	3	3	1.0	1.0
4	段媛媛	西安交通大学生命科学与技术学院生物医学信息工程教育部重点实验室	2	3	1.0	1.0