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基于内转录间隔区和β-微管蛋白部分基因及相关序列扩增多态性分子标记技术推断红曲霉系统发育关系
基于内转录间隔区和β-微管蛋白部分基因及相关序列扩增多态性分子标记技术推断红曲霉系统发育关系
作者:
张建中
李凤琴
王美美
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
内转录间隔区
β-微管蛋白
相关序列扩增多态性分子标记技术
红曲霉
系统发育
菌种鉴定
摘要:
目的 基于内转录间隔区(ITS)、β-微管蛋白(β-tubulin)部分基因和相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记技术结合形态学鉴定方法,推断不同种红曲霉的系统发育关系,寻找快速、准确鉴定红曲霉的方法.方法 以红曲霉基因组为模板,聚合酶链式反应(PCR)扩增红曲霉ITS、β-tubulin部分基因,利用Mega 7.0软件中最大似然树法构建进化树,扩增SRAP分子标记技术的特征结合序列,利用R软件phangorn包中的FigTree软件进行建树,使用除权配对(UPGMA)法进行聚类分析,通过分析不同种红曲霉系统发育关系,找寻快速、准确的鉴定方法.结果 利用ITS和β-tubulin部分基因可将31株供试菌株分为两大类,而SRAP分子标记技术可将供试菌株分为四大类,结合袁型分析和3种分子鉴定方法,参照15株红曲霉参考菌株将16株未鉴定到种的红曲霉分别鉴定为安卡红曲霉、橙色红曲霉和紫色红曲霉.结论 SRAP分子标记技术具有更多的分类依据,结合表型分析能够帮助更快、更精确的将红曲霉鉴定到种.
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文献信息
篇名
基于内转录间隔区和β-微管蛋白部分基因及相关序列扩增多态性分子标记技术推断红曲霉系统发育关系
来源期刊
中国食品卫生杂志
学科
医学
关键词
内转录间隔区
β-微管蛋白
相关序列扩增多态性分子标记技术
红曲霉
系统发育
菌种鉴定
年,卷(期)
2018,(6)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
563-569
页数
7页
分类号
R155
字数
语种
中文
DOI
10.13590/j.cjfh.2018.06.003
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
张建中
中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
140
649
13.0
18.0
2
李凤琴
国家食品安全风险评估中心国家卫生健康委员会食品安全风险评估重点实验室
46
193
8.0
11.0
3
王美美
国家食品安全风险评估中心国家卫生健康委员会食品安全风险评估重点实验室
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国食品卫生杂志
主办单位:
中华预防医学会
国家食品安全风险评估中心
出版周期:
双月刊
ISSN:
1004-8456
CN:
11-3156/R
开本:
大16开
出版地:
北京市朝阳区广渠路37号2号楼501
邮发代号:
创刊时间:
1989
语种:
chi
出版文献量(篇)
3762
总下载数(次)
7
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