半胱氨酸蛋白酶抑制因子(CST)是一种能够可逆结合并抑制半胱氨酸蛋白酶类的活性的蛋白,为了明确日本沼虾(Macrobrachium nipponense)CST基因(MnCST)序列及其在日本沼虾卵巢中的作用,本研究利用RACE方法克隆获得日本沼虾MnCST全长cDNA序列,利用qRT-PCR分析了其在不同组织和不同发育阶段的卵巢中的表达情况,并利用RNA干扰(RNAi)技术初步分析了MnCST在日本沼虾卵巢发育中的作用.结果显示,MnCST cDNA序列全长6199 bp,包含1183 bp 5′非编码区、2304 bp 3′非编码区和2709 bp开放阅读框,编码903个氨基酸残基,其氨基酸序列上有6个cystatin-like(半胱氨酸蛋白酶抑制因子样)结构域和42个磷酸化位点;MnCST基因在各个组织中均有表达,肠中表达量最高;日本沼虾不同发育阶段的卵巢中均有MnCST基因表达,Ⅳ期卵巢中表达量最高,Ⅱ期卵巢中表达量最低;MnCST基因在日本沼虾卵巢中的表达变化与组织蛋白酶B(CtsB)和组织蛋白酶L(CtsL)基因的表达变化基本是一致的,但对卵黄蛋白原(Vg)基因的表达没有直接影响.MnCST在日本沼虾卵巢中的作用可能主要是抑制CtsB和CtsL的活性,在日本沼虾卵巢发育过程中对Vg的水解起间接的调控作用.