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摘要:
目的 了解1株引起致死性食物中毒事件的唐菖蒲伯克霍尔德菌椰毒致病型菌株Co14的全基因组序列特征,对其基因组中米酵菌酸(BA)和毒黄素(TF)的生物合成相关基因进行了预测和分析.方法 通过第三代高通量测序技术(PacBio)对Co14进行全基因组测序,使用BLAST软件预测BA和TF的生物合成相关基因.结果 Co14基因组中含有2个闭合的环状染色体,大小分别为4.1和4.0 Mb,鸟嘌呤和胞嘧啶所占比例(GC含量)分别为67.82%和68.32%.Co14基因组中还携带有一个146 kb的闭合环状质粒,GC含量为63.25%,编码149个基因.通过同源序列比对,在Co14染色体1上发现了BA和TF的生物合成相关基因簇bonR1 R2LJKFGABDEHIM和toxRABCDE.结论 Co14全基因组数据为研究唐菖蒲伯克霍尔德菌食物中毒菌株的致病性和毒力因子产生机制奠定了遗传学基础.
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文献信息
篇名 唐菖蒲伯克霍尔德菌椰毒致病型菌株Co14毒力相关基因解析
来源期刊 中国食品卫生杂志 学科 医学
关键词 唐菖蒲伯克霍尔德菌椰毒致病型 食源性致病菌 全基因组分析 米酵菌酸 毒黄素 毒力基因 同源序列 比对
年,卷(期) 2018,(6) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 558-562
页数 5页 分类号 R155
字数 语种 中文
DOI 10.13590/j.cjfh.2018.06.002
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 彭子欣 国家食品安全风险评估中心国家卫生健康委员会食品安全风险评估重点实验室 7 10 2.0 2.0
2 王伟 国家食品安全风险评估中心国家卫生健康委员会食品安全风险评估重点实验室 15 40 4.0 5.0
3 徐进 国家食品安全风险评估中心国家卫生健康委员会食品安全风险评估重点实验室 11 51 3.0 6.0
4 陈雪 北京农学院食品科学与工程学院 1 1 1.0 1.0
5 李孟寒 国家食品安全风险评估中心国家卫生健康委员会食品安全风险评估重点实验室 1 1 1.0 1.0
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食源性致病菌
全基因组分析
米酵菌酸
毒黄素
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同源序列
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研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国食品卫生杂志
双月刊
1004-8456
11-3156/R
大16开
北京市朝阳区广渠路37号2号楼501
1989
chi
出版文献量(篇)
3762
总下载数(次)
7
总被引数(次)
30957
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
论文1v1指导