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云南地区宫颈癌组织中人乳头瘤病毒18型LCR基因变异特征分析
云南地区宫颈癌组织中人乳头瘤病毒18型LCR基因变异特征分析
作者:
叶超
孙强明
席珏敏
文送娇
林垚
洪珊
潘玥
王晓丹
管娇琼
陈俊英
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
人乳头瘤病毒18型(HPV-18)
长控制区
多态性
基因变异
宫颈癌
摘要:
研究云南地区人乳头瘤病毒18型LCR基因在宫颈癌组织中的变异特点,通过系统发生分析探讨HPV-18变异株的分子流行特征,并通过转录因子结合位点的预测分析LCR变异对病毒感染可能造成的影响.本研究提取了云南地区74例女性宫颈癌组织样本中的DNA,通过PCR、测序、序列比对,分析了9个HPV-18 LCR完整DNA序列的基因变异信息,并用Mega 7.0软件使用邻接法进行进化分析,使用JASPAR数据库对可能的转录因子结合位点进行预测.HPV-18 LCR序列中发现T7258A、C7529A、G7563A、A7567C、T7592C、A7670T、T7736G、C7764T、C7857T、A41G、C54T、A89C和T104C 13个核苷酸点突变,其中最常见变异位点是T7592C,其次是C7857T,突变频率分别为100%和44.4%.9个HPV-18 LCR完整DNA序列分属于4个HPV-18 LCR变异体,进化树分析显示云南地区流行的HPV-18主要为A系变异体(8个A1亚系,1个A4亚系),HPV-18 LCR中T7592C、C7857T变异位于转录因子TBP、HOXA5的结合区域内.云南地区宫颈癌组织中主要流行的HPV-18为A系变异体,T7592C、C7857T是HPV-18 LCR中主要变异位点.
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文献信息
篇名
云南地区宫颈癌组织中人乳头瘤病毒18型LCR基因变异特征分析
来源期刊
病毒学报
学科
医学
关键词
人乳头瘤病毒18型(HPV-18)
长控制区
多态性
基因变异
宫颈癌
年,卷(期)
2018,(5)
所属期刊栏目
人乳头瘤病毒研究专题论著
研究方向
页码范围
707-712
页数
6页
分类号
R373.9
字数
语种
中文
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研究来源
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研究去脉
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期刊影响力
病毒学报
主办单位:
中国微生物学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-8721
CN:
11-1865/R
开本:
大16开
出版地:
北京西城区迎新街100号
邮发代号:
82-227
创刊时间:
1985
语种:
chi
出版文献量(篇)
2313
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18
总被引数(次)
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