河南省猪流行性腹泻病毒S和ORF3基因的克隆与序列分析

• 作者: 卢婷婷 张鸿鑫 王文静 赵丽 陈红英 韩昊莹
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 河南省 猪流行性腹泻病毒 S和ORF3基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 页码范围: 25-30
• 页数: 6页
• 分类号: Q78
• 字数: 3311字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2018.04.004

摘要

为了分析河南省猪流行性腹泻病毒(PEDV)毒株S和ORF3基因变异情况,于2015年1-12月收集河南省规模化猪场的150份PED疑似病料利用RT-PCR方法进行S和ORF3基因检测,共扩增到15株PEDV的S和ORF3基因,回收纯化PCR产物克隆至T载体,并进行序列分析,结果显示,15株S基因与CV777相比,核苷酸同源性为93.6％ ～93.9％,氨基酸同源性为92.2％ ～93.1％,而且存在不同碱基插入和缺失;ORF3基因与CV777相比,核苷酸同源性为97.7％ ～100％,氨基酸同源性为93.7％ ～100％,与疫苗毒株相比,不存在氨基酸的缺失现象.进化树分析基于S基因扩增的15株独立成群,与其他参考毒株亲缘较远;基于ORF3基因扩增的15个毒株与国内分离株、美国株及韩国株均有较近的亲缘关系,与经典毒株CV777株亲缘关系较远.对于S和ORF3基因在整个进化关系中,试验中的15个河南株均相对独立成群,与经典毒株CV777及国内所使用的疫苗株,亲缘关系较远,15株河南株的S和ORF3基因存在基因变异,为河南省PED的分子流行病学研究和防控提供技术支持.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张鸿鑫	河南农业大学牧医工程学院	12	30	3.0	5.0
5	韩昊莹	河南农业大学牧医工程学院	19	36	4.0	5.0
7	卢婷婷		14	8	2.0	2.0
8	王文静		20	31	4.0	4.0
9	赵丽		11	18	3.0	3.0