基于RNA-Seq技术的向日葵油酸形成的转录组学分析

• 作者: 于海峰 张艳芳 李素萍 李美娜 赵建军 郭树春 闫明霞 陈阜 韩平安
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 向日葵 油酸 RNA-Seq 形成机理
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 769-776
• 页数: 8页
• 分类号: S565.5
• 字数: 5736字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2018.06.005

摘要

为探讨向日葵油酸调控机理,以高油酸材料J9和低油酸材料NK244为研究对象,在授粉后20d取材,采用RNA-Seq技术研究转录组.经比较分析,2个材料共鉴定到差异表达基因(DET)5 447个,其中上调表达基因2 709个,下调表达基因2 738个.对DET进行生物信息学分析,GO信息分析表明,有2 218个DET富集到57个功能条目,其中上调表达基因主要涉及催化活性、异构酶活性、碳水化合物结合、DNA结合、脂结合、碳水化合物过程、脂代谢过程和脂肪酸生物合成等;下调表达基因主要涉及蛋白激酶活性、ATP结合、蛋白磷酸化、tRNA氨酰化的蛋白质翻译和纤维素生物合成过程.KEGG分析中799个差异表达片段被显著富集在28个通路,主要为碳水化合物代谢通路和脂代谢通路.