白及丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)基因的序列分析

• 作者: 张社波 徐德林 李林 沈访 潘胤池 马激
• 来源期刊: 植物研究
• 学科: 生物学
• 关键词: 白及 丝氨酸羟甲基转移酶 序列分析 结构预测
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 543-550
• 页数: 8页
• 分类号: Q949.95
• 字数: 4711字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7525/j.issn.1673-5102.2018.04.008

摘要

丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)是植物细胞光合作用和一碳代谢的关键酶之一,研究SHMT基因的序列信息对揭示其蛋白结构与功能具有重要指导意义.从白及转录组数据库中分离得到SHMT基因(NCBI登录号:MG544187),运用生物信息学软件对该基因进行序列分析.结果显示:该基因长度为1 953 bp,编码的蛋白质长度为471aa、分子量为51.861 06 kD、理论等电点为7.17,SHMT二级结构主要由无规则卷曲结构和α螺旋结构组成,核苷酸和氨基酸序列与铁皮石斛SHMT相似性最高,达93％,结构域分析发现该蛋白具有高度保守结构域,三级结构预测为四聚体结构,跨膜区及信号肽分析发现该蛋白无跨膜区及信号肽,亚细胞定位分析发现该蛋白主要位于细胞质、叶绿体亚细胞器位置.本分析结果为白及SHMT的应用研究提供了基础数据,也为植物SHMT基因的分子研究提供了理论依据及基础资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐德林	遵义医学院细胞生物学教研室	24	69	5.0	6.0
2	李林	遵义医学院细胞生物学教研室	16	39	4.0	5.0
3	沈访		5	19	2.0	4.0
7	潘胤池	遵义医学院细胞生物学教研室	8	12	2.0	3.0
8	张社波	遵义医学院细胞生物学教研室	3	7	1.0	2.0
9	马激	遵义医学院细胞生物学教研室	3	6	2.0	2.0