抗菌肽BLFcin6与不同磷脂膜之间相互作用的分子动力学模拟研究

• 作者: 唐艳 孔真真 曹赞霞 王吉华 赵立岭
• 来源期刊: 生物化学与生物物理进展
• 关键词: BLFcin6抗菌小肽 不同成分磷脂膜 分子动力学模拟 肽膜相互作用
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 351-362
• 页数: 12页
• 语种: 中文
• DOI: 10.16476/j.pibb.2017.0256

摘要

抗菌肽具有广谱抗菌特性,有望成为抗生素较好的替代产品.研究抗菌肽的抗菌机制,可以为新型抗菌肽的设计提供指导.无论抗菌肽采用哪种抗菌机制,其首先要稳定地吸附到细胞膜之上.因此,本文利用分子动力学模拟方法比较了抗菌小肽BLFcin6与5种不同细胞膜之间的相互作用.对这5种细胞膜而言,小肽会很快结合在POPG膜和DPPC-CHOL膜的表面,倾向于进入DPPC膜的疏水内部,与POPC膜和POPC-CHOL膜的接触很少.考察相互作用能,小肽与POPG膜的相互作用最强,主要是小肽与细胞膜亲水头部存在静电相互作用;小肽与DPPC膜的疏水尾部的相互作用较强,但受胆固醇影响,小肽只结合在DPPC-CHOL膜表面.在结合过程中,小肽N端的Arg会先结合到细胞膜上,静电相互作用在小肽锚定细胞膜的过程中起关键作用.以上研究从原子水平上解释了为什么BLFcin6小肽具有抗菌作用,哪些残基起关键作用,也为进一步开展BLFcin6小肽及其衍生小肽的研究奠定基础.