杜泊羊速激肽TAC1基因克隆及生物信息学分析

• 作者: 刘玉梅 吴至博 张小辉 施会彬 李元晓 杨芳 王建平 王玉琴 甄吉福 田志龙
• 来源期刊: 中国草食动物科学
• 学科: 农学
• 关键词: 杜泊羊 TAC1 基因克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传育种与繁殖
• 页码范围: 6-12
• 页数: 7页
• 分类号: S826.2
• 字数: 4239字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-3887.2018.05.002

摘要

TAC1基因在哺乳动物神经系统中广泛表达,其编码蛋白参与季节性生殖活动的调节.该研究对杜泊羊速激肽(Tachykinin,TK)基因序列进行了克隆及生物信息学分析.结果表明:克隆出杜泊羊TAC1基因组序列,得到3个克隆片段.通过生物信息学分析,克隆片段一的长度为860 bp,经BLAST对比,与云南黑山羊第4号染色体相似度达93％,基因片段缺失4％;克隆片段二的长度为881 bp,经BLAST对比,与云南黑山羊第4号染色体相似度达100％,没有基因片段的缺失;克隆片段三的长度为846 bp,经BLAST对比,与云南黑山羊第4号染色体相似度达98％,没有基因片段的缺失,但有3个突变位点,分别为位于85 bp处的G/C突变、位于88 bp处和629 bp处的G/A突变、位于108 bp处和290 bp处的T/C突变.杜泊羊TAC1基因开放阅读框全长423 bp,共编码140个氨基酸.与GenBank已发表的其他动物TAC1基因参考序列进行比较,结果显示杜泊羊与绵羊、瘤牛、野猪、猕猴、人和大熊猫的TAC1基因同源性分别为98.9％、97.3％、88.1％、85.8％、85.0％、84.5％.通过蛋白质结构预测,发现杜泊羊TAC1基因编码蛋白没有跨膜结构域.