吐鲁番黑羊黄体期和卵泡期卵巢microRNA差异表达分析

• 作者: 周荣艳 张振红 李楠 李相运 王涵 苗艳平 锡建中 陈烨 魏彦辉
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 吐鲁番黑羊 卵泡期 黄体期 卵巢 微小RNA(miRNA)
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 660-669
• 页数: 10页
• 分类号: S826.8+9|S813.3
• 字数: 6309字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2018.04.013

摘要

为研究微小RNA(microRNA,miRNA)调控吐鲁番黑羊(Ovis aries)发情周期的机制,培育高繁殖力绵羊品种,本研究利用活体手术法分别采集3只吐鲁番黑羊卵泡期和黄体期的一侧卵巢,采用高通量测序获取miRNA数据并进行生物信息学分析,构建和分析吐鲁番黑羊卵巢miRNA在卵泡期和黄体期的表达谱及其差异表达,筛选两时期差异表达miRNA的靶基因进行基因功能注释(Gene Ontology,GO)和通路富集分析(Kyoto Encyclopedia Of Genes and Genomes,KEGG),利用qRT-PCR随机选择3个差异表达的miRNA进行表达水平的验证.获得了吐鲁番黑羊黄体期和卵泡期卵巢表达的已知miRNA 139个,其中126个在两个时期共表达,3个在黄体期特异表达,10个在卵泡期特异表达,并筛选出吐鲁番黑羊两个时期19个差异表达miRNA;GO和KEGG分析结果表明吐鲁番黑羊两个时期差异表达miRNA靶基因分别在抗原处理和提呈、内质网中蛋白质的处理、蛋白酶体、溶酶体和利什曼病5个通路中达到显著富集;qRT-PCR结果显示,选择的3个差异表达miRNA表达水平与测序结果一致.研究获得了吐鲁番黑羊黄体期和卵泡期卵巢组织中miRNA的表达谱,并筛选出差异表达的miRNA及其预测靶基因所参与的信号通路,为该品种后续的卵巢miRNA的研究提供基础资料.结合GO和KEGG分析结果推测差异表达miRNA是通过靶基因参与免疫、蛋白质加工相关通路调节吐鲁番黑羊的繁殖活动.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张振红	河北农业大学动物科技学院	73	368	11.0	16.0
2	锡建中	河北农业大学动物科技学院	44	93	5.0	7.0
3	李相运	河北农业大学动物科技学院	29	85	5.0	7.0
4	周荣艳	河北农业大学动物科技学院	105	307	9.0	11.0
5	陈烨	河北农业大学动物科技学院	7	6	1.0	2.0
6	王涵	河北农业大学动物科技学院	7	8	2.0	2.0
7	苗艳平	河北农业大学动物科技学院	5	7	2.0	2.0
8	魏彦辉	河北农业大学动物科技学院	11	23	3.0	4.0