单分子动力学研究大肠杆菌单链结合蛋白与单链 DNA的结合过程

• 作者: 徐春华 李明 滕翠娟 陆越 陆颖 马建兵
• 来源期刊: 物理学报
• 关键词: 单分子动力学 单链结合蛋白 结合过程 自由能
• 年，卷（期）: 2018,（8）
• 所属期刊栏目: 物理学交叉学科及有关科学技术领域
• 页码范围: 247-256
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.7498/aps.67.20180109

摘要

大肠杆菌单链结合蛋白(E.coli SSB)具有与单链DNA(single-stranded DNA,ssDNA)结合的性质,起着保护ssDNA及引导相关蛋白质反应的重要作用,然而,它与ssDNA的结合过程及其细节尚未得到确定的研究结果.本文采用单分子磁镊对E.coli SSB/ssDNA复合体进行拉力测试,并采用单分子化学反应动力学方法对测试结果进行分析.研究发现:E.coli SSB在ssDNA上的结合过程分为两个不同的阶段,一个是在临界力下快速的结合缠绕阶段,一个是随着力的进一步减小逐步缠绕的阶段.从中得到了E.coli SSB与ssDNA的化学反应系数,并得到了相应的自由能参数.采用自由能校准的方法,得到了SSB与ssDNA结合的完整自由能曲线,从而揭示了E.coli SSB与ssDNA的结合特征.本文的分析方法也可以应用于相似的化学反应的研究中.