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家蚕油蚕oc突变体突变基因的精细定位
家蚕油蚕oc突变体突变基因的精细定位
作者:
刘春
朱勇
杨成飞
林英
殷娅茹
王凌燕
王坤
胡建
胡文波
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
家蚕
油蚕突变体
尿酸
oc突变体
精细定位
摘要:
[目的]油蚕oc突变体是家蚕Bombyx mori油蚕突变体的一种,经典遗传学连锁图谱已经将oc突变基因定位在5号染色体40.8 cM座位.本研究旨在对oc突变体候选基因进行精细定位并克隆,探究oc性状形成的分子机制.[方法]以油蚕oc突变品系和野生型家蚕品系大造(Dz)为亲本,其杂交产生的F1代雄性个体与oc突变的雌性个体进行回交得到的1397头BC1代个体为定位材料,以家蚕已经报道的基因组序列为参考设计markers,通过亲本及F1代个体筛选多态性markers,并利用多态性markers和BC1代个体对oc突变基因进行精细定位.通过半定量RT-PCR和实时荧光定量PCR(qPCR)筛选oc紧密连锁区间内的候选基因,确定目标候选基因,继而克隆和测序该基因,分析油蚕oc突变的原因.[结果]利用1 397头BC1代个体和11对有效的多态性markers将oc突变基因定位在M10与M11两个markers之间,物理图谱距离大约为234 kb.通过家蚕基因组数据库对oc连锁区域内的基因进行检索发现该区域有5个预测基因.对这5个预测基因在10个家蚕品系中进行的表达分析发现,只有BGIBMGA003572基因在oc突变个体体壁的表达量明显比正常个体中的低.通过基因的同源分析发现该基因编码的蛋白和人类单羧酸转运蛋白9(可能的尿酸转运蛋白)是同源蛋白,推测其为oc突变的候选基因.对BGIBMGA003572进行的克隆和测序结果显示其编码序列有5个氨基酸在oc突变体中发生了突变.[结论]通过定位克隆,本研究将oc突变基因定位在了234 kb的紧密连锁区间,其中编码单羧酸转运蛋白9的BGIBMGA003572可能和oc突变体的表型有关.
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篇名
家蚕油蚕oc突变体突变基因的精细定位
来源期刊
昆虫学报
学科
生物学
关键词
家蚕
油蚕突变体
尿酸
oc突变体
精细定位
年,卷(期)
2018,(6)
所属期刊栏目
生理与生化
研究方向
页码范围
627-636
页数
10页
分类号
Q341
字数
语种
中文
DOI
10.16380/j.kcxb.2018.06.001
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研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
昆虫学报
主办单位:
中国科学院动物研究所
中国昆虫学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0454-6296
CN:
11-1832/Q
开本:
16开
出版地:
北京市朝阳区北辰西路1号院5号中国科学院动物研究所
邮发代号:
创刊时间:
1950
语种:
chi
出版文献量(篇)
3602
总下载数(次)
9
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