膀胱癌组织某一特异性EST片段全长扩增及生物信息学分析

• 作者: 任来成 史舒 胡少华 赵振理 郝川
• 来源期刊: 山东医药
• 学科: 医学
• 关键词: 膀胱癌 基因 表达序列标签片段 变异 KR780251 AKO62675 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（12）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 18-21
• 页数: 4页
• 分类号: R737.14
• 字数: 3302字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-266X.2018.12.005

摘要

目的 对膀胱癌组织某一特异性表达序列标签(EST)片段迸行全长扩增及生物信息学分析.方法 收集1例迸行手术的膀胱癌患者(病理证实为膀胱移行细胞癌)的癌组织,从新鲜的膀胱癌组织中提取RNA,利用RACE方法获取前期研究发现的某一特异性EST片段5′端和3′端DNA序列,通过GeneTool软件合成RACE测序结果.对全长序列及其相应蛋白迸行生物信息学分析,利用sequin软件编辑分析结果,并向NCBI提交获取基因号及蛋白号.结果 成功获得该特异性EST片段的5′端和3′端,利用GeneTool软件合成一个1839 bp的全长序列,初步分析其含有完整的开放阅读框(ORF),染色体定位于17p13.3.该序列在GeneBank获得基因号为KR780251, ORF翻译的多肽序列获得蛋白ID为AKO62675.结论 该膀胱癌组织特异性EST片段基因号为KR780251,全长序列为1839 bp,含有完整的ORF,其编码蛋白AKO62675可能是正常膀胱组织的基因突变体.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郝川		19	37	3.0	5.0
2	史舒		13	28	3.0	4.0
3	任来成		33	66	4.0	6.0
4	赵振理		4	1	1.0	1.0
5	胡少华		4	1	1.0	1.0