沙棘H3K9乙酰化修饰全基因组分析

• 作者: 何彩云 张彤 陈道国 高国日
• 来源期刊: 西北植物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 沙棘 H3K9ac 蛋白质印迹法 染色质免疫共沉淀技术
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 242-248
• 页数: 7页
• 分类号: Q786|Q789
• 字数: 4386字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1000-4025.2018.02.0242

摘要

为了绘制沙棘H3K9乙酰化修饰图谱,确定H3K9乙酰化修饰所调控的基因,该实验通过Western blot验证抗体与组蛋白的结合能力和ChIP-seq验证抗体富集效率,获得全基因组范围内沙棘H3K9乙酰化修饰图谱和调控基因.实验结果表明,H3K9ac抗体与复合物具有较强的结合能力.对富集到的DNA片段进行高通量测序,分别获得2.2×107和3.6×107条原始序列;唯一比对序列广泛分布于沙棘基因组中,并且在结构基因中的两端具有明显的富集.对富集区进行峰的预测结果显示,共预测出1 011个峰;对峰所处部位基因进行功能预测结果发现,H3K9ac对于沙棘细胞代谢和信号转导基因的表达具有重要调控作用.沙棘片段化DNA的富集以及高通量测序结果证明,抗体能够用于研究沙棘的组蛋白修饰类型,并且绘制了沙棘第一张H3K9乙酰化修饰遗传图谱草图,鉴定出沙棘H3K9乙酰化修饰所调控的基因,为今后研究组蛋白修饰对沙棘基因表达的调控方式奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	何彩云	中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室	25	375	10.0	19.0
3	高国日	中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室	3	20	2.0	3.0
4	张彤	中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室	3	1	1.0	1.0
5	陈道国	中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室	3	4	1.0	2.0