乳腺癌中c-MYC调节的剪接基因鉴定及其临床意义分析

• 作者: 张永明 王一澎 马飞
• 来源期刊: 癌症进展
• 学科: 医学
• 关键词: 乳腺癌 c-MYC 可变剪接 预后
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 558-562
• 页数: 5页
• 分类号: R737.9
• 字数: 3604字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11877/j.issn.1672-1535.2018.16.05.08

摘要

目的 鉴定c-MYC调节的剪接相关基因,分析其基因组水平的改变,并评价其潜在的预后价值.方法 采用癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)数据库分析乳腺癌中与c-MYC共表达的基因;功能富集分析剪接相关基因;采用String蛋白数据库绘制剪接基因互作网络图;采用TCGA数据库分析剪接基因在基因组水平的改变,包括突变、扩增和缺失等,对比淋巴瘤剪接基因研究确定候选基因;采用Kaplan-Meier plotter数据库分析候选基因与乳腺癌患者生存的关系.结果 乳腺癌中与c-MYC共表达的基因中剪接基因共有16个,主要为剪接体复合物、U12-型剪接体复合物和剪接体snSNP复合物.这16个剪接基因在乳腺癌中均有不同比例的拷贝数扩增.本研究分析的乳腺癌数据中与c-MYC共表达的基因与已知的淋巴瘤中的基因存在多个重叠基因,即WDR77、GEMIN4和SNRPD1,这3个基因的表达与乳腺癌患者的总生存期和无复发生存期均有关.结论 在乳腺癌中鉴定了16个c-MYC调节的剪接基因,这些基因在乳腺癌中大多存在拷贝数扩增,其中WDR77、GEM-IN4和SNRPD1可作为乳腺癌预后的标志分子.