植物UGD基因家族系统发育分析及在棉纤维中的表达分析

• 作者: 何易航 张岚 潘玉欣 王希胤 王振怡 肖嵩
• 来源期刊: 河北农业大学学报
• 关键词: 棉花 UDP-葡萄糖脱氢酶 进化分析 基因家族 表达
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 页码范围: 29-36
• 页数: 8页
• 分类号: Q786
• 语种: 中文
• DOI: 10.13320/j.cnki.jauh.2018.0051

摘要

尿苷二磷酸葡萄糖醛酸(UDP-glucose dehydrogenase,UGD)是植物细胞壁合成的主要前体物质.本研究利用生物信息学方法分析了15个植物基因组中UGD基因家族的基因结构,系统进化,以及其中7个双子叶植物的种内共线性,染色体定位.利用荧光定量PCR方法分析了UGD家族基因在陆地棉棉纤维不同发育时期的表达.结果表明:15个物种中共鉴定出56个UGD基因,可聚为2个进化群,藻类单独成一个群,其他植物构成一个群,各物种均有UGD家族基因的特异进化枝.藻类植物UGD家族均含有内含子.大片段复制是UGD家族基因扩增的主要动力.12个陆地棉UGD基因在棉纤维不同发育时期均有表达,多数基因在20DPA或25DPA基因表达量较高.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张岚	华北理工大学生命科学学院	16	31	4.0	5.0
2	王振怡	华北理工大学生命科学学院	4	13	2.0	3.0
3	潘玉欣	华北理工大学生命科学学院	10	6	2.0	2.0
4	何易航		2	2	1.0	1.0
5	肖嵩	华北理工大学生命科学学院	1	2	1.0	1.0
6	王希胤	华北理工大学生命科学学院	7	6	2.0	2.0