丹参细胞分裂素调控因子序列特征分析

• 作者: 冯园园 周昌浩 宋振巧 林彩彩 王建华 金花
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 丹参 细胞分裂素调控因子 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（11）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 2217-2227
• 页数: 11页
• 分类号: S567.5+3
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2018-0376

摘要

细胞分裂素通过双元信号系统感知外界环境刺激并作出应答.其中细胞分裂素响应调控因子(response regulator,RR)是该双元信号系统中的重要构成.采用生物信息学的方法,对丹参(Salvia miltiorrhiza)细胞分裂素调控因子进行序列特征和组织表达特性分析.结果发现,丹参基因组中共有15个丹参细胞分裂素调控因子SmRR,序列比对与系统发生分析表明,SmRR1 ～ SmRR7与拟南芥A类RR亲缘关系比较接近,划分为A类RR,SmRR8 ～ SmRR15与拟南芥B类RR亲缘关系近,归为B类;在A类SmRR中,REC接受域含有保守的DDK残基,因此这些基因被推测有完整的功能,B类SmRR具有高度保守Myb_SHAQKYF结构域.两类SmRR的内含子、外显子组成也具有相对的保守性,顺式调控元件的分析发现,SmRR存在很多胁迫和生长调节物质的响应元件.表达量热图显示A类和B类SmRR基因分别在叶和根中表达量较高.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王建华	山东农业大学农学院	108	1628	20.0	35.0
2	宋振巧	山东农业大学农学院	25	358	10.0	18.0
3	冯园园	山东农业大学农学院	3	0	0.0	0.0
4	林彩彩	山东农业大学农学院	2	0	0.0	0.0
5	周昌浩	山东农业大学农学院	2	0	0.0	0.0
6	金花	山东农业大学农学院	1	0	0.0	0.0